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documentation:tools:software:trinity [2018/03/30 09:14] – [Trinity] cpetitdocumentation:tools:software:trinity [2022/09/13 12:36] (Version actuelle) – [Trinity] ltaulell
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 ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ ^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^
-|  2.6.6  |  gcc-6.3.0  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/Local/Trinity/2.6.6  |  Debian 9  |+|  2.14.0  |  foss-2021b  |  N/A  |  N/A  |  Debian 11  | 
 +| | **modulefile** :  Trinity/2.14.0-foss-2021b-Python-3.9.6 |||| 
 +|  2.6.6  |  GCC/6.3.0  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/Local/Trinity/2.6.6  |  Debian 9  |
 | | **modulefile** : Trinity/2.6.6  |||| | | **modulefile** : Trinity/2.6.6  ||||
-|  2.5.1  |  GCC/6.4.0 - OpenMPI/3.0.0  |  N/A  |  ${APPLIS}/MPI/GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/Trinity/2.5.1/trinityrnaseq-Trinity-v2.5.1  |  Debian 9  | +|  2.5.1  |  GCC/6.4.0 - OpenMPI/3.0.0  |  N/A  |  /applis/PSMN/debian9/software/Local/Trinity/2.5.1  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/Trinity/2.5.1  ||||+| | **modulefile** : Trinity/2.5.1  |||| 
 +|  2.2.0   gcc-6.3.0   N/A  |  /usr/bin   Debian 9  | 
 +| | **modulefile** : aucun  |||| 
  
-<code bash>APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software</code> 
  
 Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]]
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 ### Modulefiles ### Modulefiles
-source /usr/share/modules/init/bash +source /usr/share/lmod/lmod/init/bash 
-module use /applis/PSMN/Modules +module load Trinity/2.5.1
-module load Base/psmn +
-module load Trinity/r20140413+
 # #
  
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 SCRATCHDIR=${SGE_O_WORKDIR/home/scratch} SCRATCHDIR=${SGE_O_WORKDIR/home/scratch}
 mkdir -p $SCRATCHDIR mkdir -p $SCRATCHDIR
- 
  
  
documentation/tools/software/trinity.1522401273.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)