Administrer
documentation:tools:software:vasp

Différences

Ci-dessous, les différences entre deux révisions de la page.

Lien vers cette vue comparative

Les deux révisions précédentesRévision précédente
Prochaine révision		Révision précédente
documentation:tools:software:vasp [2014/11/17 14:17] – [VASP] ltaulelldocumentation:tools:software:vasp [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
Ligne 3: Ligne 3:
 <WRAP round important>**Accès réservé aux utilisateurs autorisés**</WRAP> <WRAP round important>**Accès réservé aux utilisateurs autorisés**</WRAP>
  
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^  modèle de configuration  ^ +VASP est soumis à licence. Les binaires pour le Laboratoire de Chimie sont dans ''/Xnfs/chimie/vasp/executables/''.
-|  4.6.36  |  gcc 4.6  |  Infiniband  |  /softs/Debian7/VASP/4.6.36/standard/vasp.4.6/  |  Debian 7  |  N/A  |+
  
- 
-VASP est soumis à licence. Les binaires pour le Laboratoire de Chimie sont dans ''/home/vasp/''. 
- 
- 
-{{INLINETOC}} 
  
 ====== Script de soumission (exemple) ====== ====== Script de soumission (exemple) ======
Ligne 16: Ligne 10:
   * Pour les files d'attente du cluster Equip@méso, avec /scratch commun glusterfs   * Pour les files d'attente du cluster Equip@méso, avec /scratch commun glusterfs
  
 +Un script régulièrement mis à jour est disponible dans ''/Xnfs/chimie/vasp/executables/''.
  
 ''qsub parexemple.sh'' ''qsub parexemple.sh''
 +
 +
 +<note warning>update needed</note>
  
 <code bash parexemple.sh> <code bash parexemple.sh>
Ligne 35: Ligne 33:
  
 HOMEDIR=$SGE_O_WORKDIR HOMEDIR=$SGE_O_WORKDIR
 +SCRATCHDIR=${SGE_O_WORKDIR/home/scratch}
  
 ### mettre l'env au propre ### mettre l'env au propre
-source /usr/local/modeles/set_debian7-clean.sh 
-source /usr/local/modeles/sge.sh 
-source /usr/local/modeles/openmpi-1.6.4-intel-14.0.1-debian7.sh 
  
-SCRATCHDIR=`echo $HOMEDIR | awk -F "/" '{$2="scratch"; for(j=2;j<=NF;j++) {printf("/%s",$j);} print ""} ' ` 
  
 ### serveurs ayant acces au scratch commun : e5-2670comp[1-4], pick one. ### serveurs ayant acces au scratch commun : e5-2670comp[1-4], pick one.
Ligne 117: Ligne 112:
  
  
-Vérifier le ''~/.cshrc'' ET l'env du ''vasp.j'' => il faut qu'ils correspondent.+Vérifier le ''~/.cshrc''/''~/.bashrc'' ET l'env du ''vasp.j'' => il faut qu'ils correspondent.
  
   * ''mpirun process exited on signal 10''   * ''mpirun process exited on signal 10''
Ligne 125: Ligne 120:
 </code> </code>
  
-''Signal 10 = Walltime atteint'' Le job a été lancé sur une file d'attente courte (E5-2670deb64h3 = 3 heures, E5-2670deb64d3 = 3 jours)+''Signal 10 = Walltime atteint'' Le job a été lancé sur une file d'attente courte. 
documentation/tools/software/vasp.1416233832.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)
Rechercher
Translations
Piste :
Vous êtes ici : accueil » documentation » tools » software » vasp
Navigation
Pôle Scientifique de Modélisation Numérique, ENS de Lyon - 46, allée d'Italie - 69364 Lyon cedex 07 - France
Téléphone : +33 (0)4 72 72 83 67
Sauf mention contraire, le contenu de ce wiki est placé sous les termes de la licence suivante : CC Attribution-Share Alike 4.0 International
Modified Scanlines on DokuWiki under the hood