Différences

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documentation:tools:software:vasp [2018/02/16 08:08] – [VASP] cpetitdocumentation:tools:software:vasp [2020/08/25 15:58] (Version actuelle) – modification externe 127.0.0.1
Ligne 3: Ligne 3:
 <WRAP round important>**Accès réservé aux utilisateurs autorisés**</WRAP> <WRAP round important>**Accès réservé aux utilisateurs autorisés**</WRAP>
  
-VASP est soumis à licence. Les binaires pour le Laboratoire de Chimie sont dans ''/home/vasp/executables/''.+VASP est soumis à licence. Les binaires pour le Laboratoire de Chimie sont dans ''/Xnfs/chimie/vasp/executables/''.
  
  
Ligne 10: Ligne 10:
   * Pour les files d'attente du cluster Equip@méso, avec /scratch commun glusterfs   * Pour les files d'attente du cluster Equip@méso, avec /scratch commun glusterfs
  
-Un script régulièrement mis à jour est disponible dans ''/home/vasp/executables/''.+Un script régulièrement mis à jour est disponible dans ''/Xnfs/chimie/vasp/executables/''.
  
 ''qsub parexemple.sh'' ''qsub parexemple.sh''
 +
 +
 +<note warning>update needed</note>
  
 <code bash parexemple.sh> <code bash parexemple.sh>
Ligne 30: Ligne 33:
  
 HOMEDIR=$SGE_O_WORKDIR HOMEDIR=$SGE_O_WORKDIR
 +SCRATCHDIR=${SGE_O_WORKDIR/home/scratch}
  
 ### mettre l'env au propre ### mettre l'env au propre
-source /usr/local/modeles/set_debian7-clean.sh 
-source /usr/local/modeles/sge.sh 
-source /usr/local/modeles/openmpi-1.6.4-intel-14.0.1-debian7.sh 
  
-SCRATCHDIR=${SGE_O_WORKDIR/home/scratch} 
  
 ### serveurs ayant acces au scratch commun : e5-2670comp[1-4], pick one. ### serveurs ayant acces au scratch commun : e5-2670comp[1-4], pick one.
Ligne 112: Ligne 112:
  
  
-Vérifier le ''~/.cshrc'' ET l'env du ''vasp.j'' => il faut qu'ils correspondent.+Vérifier le ''~/.cshrc''/''~/.bashrc'' ET l'env du ''vasp.j'' => il faut qu'ils correspondent.
  
   * ''mpirun process exited on signal 10''   * ''mpirun process exited on signal 10''
Ligne 120: Ligne 120:
 </code> </code>
  
-''Signal 10 = Walltime atteint'' Le job a été lancé sur une file d'attente courte (E5-2670deb64h3 = 3 heures, E5-2670deb64d3 = 3 jours)+''Signal 10 = Walltime atteint'' Le job a été lancé sur une file d'attente courte
documentation/tools/software/vasp.1518768497.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)