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documentation:tools:software:htslib [2018/01/29 15:09] – [HTSlib] cpetitdocumentation:tools:software:htslib [2023/01/13 09:18] (Version actuelle) – supprimée ltaulell
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-====== HTSlib ====== 
- 
-  * a unified C library for accessing common file formats, such as //SAM, CRAM// and //VCF//, used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by [[documentation:tools:software:samtools|samtools]] and [[documentation:tools:software:bcftools|bcftools]]. 
- 
-^  Version  ^  Compilateur  ^  Interconnexion  ^  chemin d'accès  ^  OS  ^ 
-|  1.6  |  GCC/7.2.0 OpenMPI/3.0.0  |  N/A  |  ''${APPLIS}/MPI/GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0/HTSlib/1.6/bin''  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : '' GCC/7.2.0/OpenMPI/3.0.0/HTSlib/1.6'' |||| 
-|  1.6  |  GCC/6.4.0 OpenMPI/3.0.0  |  N/A  |  ''${APPLIS}/MPI/GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/HTSlib/1.6/bin''  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : '' GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/HTSlib/1.6'' |||| 
-|  1.6  |  GCC/5.4.0  |  N/A  |  ''${APPLIS}/Compiler/GCC/5.4.0/HTSlib/1.6/bin''  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : '' GCC/5.4.0/HTSlib/1.6'' |||| 
-|  1.1  |  GCC/6.4.0 OpenMPI/3.0.0  |  N/A  |  ''${APPLIS}/MPI/GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/HTSlib/1.1/bin''  |  Debian 9  | 
-| | **modulefile** : '' GCC/6.4.0/OpenMPI/3.0.0/HTSlib/1.1'' |||| 
- 
- 
-<code>APPLIS=/applis/PSMN/debian9/software</code> 
- 
-Pour utiliser les modules, consulter [[documentation:tools:modules|Environment Modules]] 
- 
-{{INLINETOC}} 
- 
- 
-==== Doc Admin-sys PSMN ==== 
- 
-  * http://www.htslib.org/download/ 
- 
-<code> 
-make prefix=/applis/PSMN/debian7/HTSlib/1.1 install 
-</code> 
- 
-===== Site officiel ===== 
-   *https://github.com/samtools/htslib 
-   *http://www.htslib.org/ 
- 
- 
  
documentation/tools/software/htslib.1517238598.txt.gz · Dernière modification : 2020/08/25 15:58 (modification externe)